Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN4BQ8IWT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN4BQ8IWT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms