Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3BQ8IVW6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3BQ8IVW6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3BQ8IVW6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3BQ8IVW6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3BQ8IVW6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3BQ8IVW6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3BQ8IVW6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3BQ8IVW6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3BQ8IVW6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3BQ8IVW6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms