Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3FQ8IUX4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3FQ8IUX4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3FQ8IUX4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms