Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFR1Q86XK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SFR1Q86XK3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms