Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARM1Q86X55 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms