Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT25Q7Z3Z0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT25Q7Z3Z0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT25Q7Z3Z0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT25Q7Z3Z0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT25Q7Z3Z0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT25Q7Z3Z0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT25Q7Z3Z0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT25Q7Z3Z0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms