Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX7Q7RTT5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX7Q7RTT5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX7Q7RTT5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX7Q7RTT5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX7Q7RTT5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX7Q7RTT5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX7Q7RTT5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms