Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDPD3Q7L5L3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDPD3Q7L5L3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms