Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED13LQ71F56 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MED13LQ71F56 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED13LQ71F56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED13LQ71F56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED13LQ71F56 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms