Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFLNAQ6ZTI6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFLNAQ6ZTI6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms