Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI0

OTOG, Otogelin, humanhuman

Predictions only

Length 2,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOGQ6ZRI0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTOGQ6ZRI0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOGQ6ZRI0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTOGQ6ZRI0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms