Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL4Q6ZR62 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms