Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINGO4Q6UY18 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 710.2 ms