Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VSTM1Q6UX27 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms