Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCLAT1Q6UWP7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCLAT1Q6UWP7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms