Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD1Q6UWL2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms