Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASC1Q6TDU7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CASC1Q6TDU7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms