Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHC4Q6S5L8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHC4Q6S5L8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHC4Q6S5L8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms