Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED9Q6R2W3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
ZBED9Q6R2W3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms