Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BLOC1S2Q6QNY1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLOC1S2Q6QNY1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BLOC1S2Q6QNY1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms