Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNV1Q6PIU1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms