Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ULK3Q6PHR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK3Q6PHR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms