Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL35Q6PF15 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms