Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFXN4Q6P4A7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms