Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC41PQ6P2S7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms