Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1Q6P1K2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMF1Q6P1K2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms