Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RWDD4Q6NW29 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms