Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms