Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUPD1Q68J44 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUPD1Q68J44 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms