Protein–RNA interactions for Protein: Q68D42

TMEM215, Transmembrane protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM215Q68D42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM215Q68D42 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM215Q68D42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms