Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF13Q5VWM6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF13Q5VWM6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms