Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR78Q5VTH9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
WDR78Q5VTH9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms