Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EEF1A1P5Q5VTE0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms