Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF17Q5VTA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF17Q5VTA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF17Q5VTA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms