Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIF1Q5UIP0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIF1Q5UIP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIF1Q5UIP0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms