Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
HDGFL1Q5TGJ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDGFL1Q5TGJ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDGFL1Q5TGJ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms