Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC3LQ5T215 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRAPPC3LQ5T215 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRAPPC3LQ5T215 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms