Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN11Q5T124 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBXN11Q5T124 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms