Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHYHD1Q5SRE7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms