Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT1Q5JUK3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms