Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM47AQ5JRC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM47AQ5JRC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM47AQ5JRC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM47AQ5JRC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM47AQ5JRC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM47AQ5JRC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM47AQ5JRC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms