Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM61Q5EBN2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms