Protein–RNA interactions for Protein: Q5BIV9

SPRN, Shadow of prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRNQ5BIV9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRNQ5BIV9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRNQ5BIV9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRNQ5BIV9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRNQ5BIV9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRNQ5BIV9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRNQ5BIV9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRNQ5BIV9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms