Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC23Q53EV4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms