Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FNDC1Q4ZHG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNDC1Q4ZHG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms