Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms