Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPP1Q16831 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
UPP1Q16831 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPP1Q16831 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms