Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PDK4Q16654 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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