Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIL3Q16649 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIL3Q16649 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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