Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMN1Q16637 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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